過濾器必須有2種或以上的過濾方式即：物理過濾、生化過濾、化學(xué)過濾

物理過濾：它是利用機械辦法將水中較大的顆粒隔出掉。如剩余的飼料顆粒、死亡魚只的尸骨、魚體的排泄物、分泌物、嘔吐物、體表粘液等，一般多使用海綿、噴膠棉、細(xì)網(wǎng)目的尼龍網(wǎng)、棕櫚葉纖維等。通常是設(shè)置在過濾系統(tǒng)的初始端，便于清洗。

生物過濾： 培養(yǎng)有益菌菌，通過細(xì)菌分解有害元素，如：氨鹽、亞硝酸鹽、硝酸鹽、磷酸鹽等等。常用的濾料有：生化球、陶瓷環(huán)、玻璃環(huán)、珊瑚砂等等（最主要的過濾方式，維持生態(tài)系統(tǒng)）

化學(xué)過濾： 它是利用化學(xué)制劑除去水的雜質(zhì)的辦法，所使用的制劑有水質(zhì)安定劑、絮凝劑、除藻劑、蛋白質(zhì)分解劑、除臭劑等等

吸附過濾：它是木材、煤炭、果殼、動物骨等含碳量極高的物質(zhì)能吸附海水中的蛋白質(zhì)、微量元素、脫色、除異味，連臭氧的分子也能被它吸收。魚兒的尿液，水中的微藻以及藥物也都能被它吸附掉

因為硝化細(xì)菌必須生活有流動的水的濾棉、玻璃環(huán)或底砂里，所以過濾器應(yīng)該24小時開。

按過濾原理分類1.自清洗過濾器　自清洗過濾器是一種利用濾網(wǎng)直接攔截水中的雜質(zhì)，去除水體懸浮物、顆粒物，降低濁度，凈化水質(zhì)，減少系統(tǒng)污垢、菌藻、銹蝕等產(chǎn)生,以凈化水質(zhì)及保護(hù)系統(tǒng)其他設(shè)備正常工作的精密設(shè)備。